La farmacia es probablemente el negocio con más casuística de facturación de todos los que analizamos: convive la venta libre en mostrador con la dispensación con receta financiada, la facturación mensual al Servicio de Salud a través del colegio, y la venta a residencias y clínicas.
Tu fecha: 1 de enero de 2027 si el negocio es una sociedad, 1 de julio de 2027 si eres autónomo. Hasta entonces no hay obligación: la AEAT considera este periodo como fase de pruebas.
Tres flujos distintos en el mismo mostrador
- Venta libre. Ticket al cliente. Lo emite tu TPV, y es tu TPV quien tiene que ser conforme.
- Dispensación con receta. La parte que paga el paciente se documenta en el mostrador; la parte financiada sigue el circuito de facturación al Servicio de Salud correspondiente.
- Facturación mensual al SNS. Se canaliza normalmente a través del Colegio Oficial de Farmacéuticos, con sus propios plazos, formatos y sistemas.
El punto clave: el circuito colegial no te exime de nada en tu venta de mostrador. Son cosas distintas y hay que resolverlas por separado.
Habla primero con tu proveedor de software de farmacia
Las farmacias no usan software de facturación genérico: usan programas de gestión de farmacia específicos, integrados con receta electrónica y con el circuito colegial. Ese es el proveedor con el que hay que hablar, y las preguntas son:
- Si tu versión concreta emite registros conformes para la venta de mostrador.
- Si la actualización va incluida en tu cuota de mantenimiento.
- Cómo queda el QR en tu impresora de tickets.
- Qué pasa con las ventas que hagas fuera del programa, si es que las hay.
Un programa de facturación genérico no va a sustituir a tu software de farmacia. Como mucho te servirá para la facturación a residencias o a empresas, que es un volumen menor.
Los tipos de IVA
En farmacia conviven varios tipos impositivos —medicamentos, productos sanitarios, parafarmacia, cosmética— y algunos productos tienen tratamiento específico. El desglose tiene que salir correcto del sistema en cada ticket, no ajustarse después.
Facturación a residencias, clínicas y empresas
Aquí sí emites factura completa, normalmente mensual y con datos del destinatario. Es la parte donde un programa de facturación estándar tiene sentido: volumen bajo, importes altos, cliente identificado.
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Lo que hay que verificar sí o sí
- Que la venta de mostrador emita registros conformes desde tu software de farmacia.
- Que el QR se imprima legible en tu rollo actual.
- Que las devoluciones se documenten con rectificativa, no borrando el ticket.
- Que el desglose por tipo de IVA sea correcto sin intervención manual.
Más sectores en Verifactu por sectores. Los precios reales de cada programa, en la comparativa.
Preguntas frecuentes
¿La facturación al Servicio de Salud me exime de Verifactu?
No. El circuito colegial de facturación al SNS es independiente de tu venta de mostrador, que sigue necesitando un sistema conforme.
¿Con quién tengo que hablar?
Con tu proveedor de software de farmacia, no con un fabricante de software de facturación genérico. Pregúntale si tu versión concreta emite registros conformes y si la actualización va incluida.
¿Cómo se gestionan los distintos tipos de IVA?
El desglose tiene que salir correcto del sistema en cada ticket, sin ajustes manuales posteriores. En farmacia conviven varios tipos y es un punto habitual de error.
¿Y la facturación a residencias y empresas?
Ahí emites factura completa, normalmente mensual. Para ese volumen te vale un programa de facturación estándar.
Precios verificados el 22 de agosto de 2026 en la web oficial de cada fabricante. Contenido divulgativo, no asesoramiento fiscal.